Nació como Colegio Nacional Emilio Cifuentes ya que fue fundado por el Licenciado Emilio Cifuentes eminente educador y líder en el Municipio, en el año 1941 mediante decreto 1282 del 18 de julio, e iniciando sus labores el 8 de Agosto de este mismo año; hoy en día es una Institución Educativa.
Que cuenta con dos sedes; Colegio Nacional y la Concepción, donde se ofrecen, los niveles preescolar, básica primaria, básica secundaria y media, en dos jornadas académicas mañana y tarde, a dos mil quinientos estudiantes y quien el próximo 8 de Agosto cumple 71 años de servicio, no solamente a la comunidad Facatativeña si no del país.
Sus rectores se han destacado por su Visión, idoneidad y entereza administrativa y por hacer de esta institución una de las mejores del país de donde han egresado eminentes personajes de la vida pública nacional; su primer rector en 1941 fue, el Doctor Jorge Caro Paz al cual presidieron eminentes lideres administrativos.
En la actualidad está dirigido por la Licenciada Luz Marina Gaitán Mahecha, quien ha dado un giro importante a la administración del Emilio, infundado en toda la comunidad educativa disciplina, orden y valores con ello ubicándola en un lugar privilegiado no solamente del Municipio si no del departamento.
Su lema “SURSUM” Siempre arriba siempre adelante.
